TÜBİTAK’ın; ülkeler arası bilim insanlarının proje yapmalarını uluslararası seyahat masrafları, küçük ekipmanlar, yazılım ve benzeri masrafların karşılanması yoluyla desteklediği, ikili işbirliği programlarından sürekli başvuruya açık olan programlar aşağıda verilmektedir:
2501 – ABD Ulusal Bilim Vakfı (NSF) ile İkili İşbirliği Programı
2502 – Bulgaristan Bilimler Akademisi (BAS) ile İkili İşbirliği Programı
2507 – Almanya Araştırmalar Konseyi (DFG) ile İkili İşbirliği Programı
2513 – Slovakya Bilimler Akademisi (SAS) ile İkili İşbirliği Programı
2525 – Almanya Eğt. ve Arş. Bakanlığı (BMBF) ile İkili İşbirliği Programı
2526 – Moğolistan Bilimler Akademisi (MAS) ile İkili İşbirliği Programı
2500 – Test Program for Joint Application and Evaluation System
TÜBİTAK’a yapılacak proje başvurularının elektronik başvuru sistemi üzerinden yapılması gerekmektedir.